【原作とアニメの違い】
アニメ第１期：原作
１～４話：１巻１～４話
５話(*1)：２巻１～２話
６～７話：２巻３話
８話：２巻４話
９話(*2)：２巻エピローグと３巻１～２話
10話(*3)：３巻２～３話
11話：３巻３～４話
12話(*4)：３巻４話
ＯＶＡ：４巻３～４話
*1…シャルロットとラウラが転校した日が異なる
*2…五反田兄妹に会う追加シーンあり
*3…束が登場するタイミングが異なる
*4…『銀の福音（シルバリオ・ゴスペル）』が無人機になっているため、ナターシャが登場しない
アニメ第２期：原作
１話：４巻１～２話、エムの侵入（６巻１話）
２～４話(*1)：５巻
５話(*2)：オリジナル、６巻４話（一夏の誕生日）とエピローグ（エムとの遭遇）
６話：オリジナル（パンツ編）
７～９話(*3)：７巻
10話：８巻１話（身体測定まで）、オリジナル、８巻４話（束とスコール）
11～12話：京都を舞台にしたオリジナル
*1…『各部対抗織斑一夏争奪戦』がない
生徒会の話がない→のほほんさんの姉、布仏虚（のほとけうつほ）が登場しない
学園祭の招待券がない→五反田弾が学園祭に来ない→当然、布仏虚との出会いもない
一夏が生徒会副会長になる話がない→一夏の部活への貸し出しもない
ＩＳ学園の実質的運営者、轡木十蔵（くつわぎじゅうぞう）が登場しない
*2…６巻の１～３話（『キャノンボール・ファスト』編）はカット
*3…五反田蘭との絡みがない→蘭の学園祭に行く話や箒とディナーに行く話がない
